Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARD1Q99728 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 426.5 ms