Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3R4Q99570 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PIK3R4Q99570 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PIK3R4Q99570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms