Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NODALQ96S42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NODALQ96S42 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms