Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCEEQ96PE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCEEQ96PE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCEEQ96PE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms