Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFXN2Q96NB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN2Q96NB2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms