Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1Q96NA8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms