Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
JSRP1Q96MG2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms