Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRIQ1Q96JM4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRIQ1Q96JM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
LRRIQ1Q96JM4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRIQ1Q96JM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
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