Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM17Q96I25 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM17Q96I25 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM17Q96I25 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM17Q96I25 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms