Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD3Q96ES6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms