Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHFRQ96EP1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHFRQ96EP1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms