Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC102AQ96A19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC102AQ96A19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC102AQ96A19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms