Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNPO1Q92973 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNPO1Q92973 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms