Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAPC3Q92966 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC3Q92966 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms