Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATA6Q92908 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATA6Q92908 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms