Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPCAT1Q8NF37 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LPCAT1Q8NF37 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LPCAT1Q8NF37 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms