Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF548Q8NEK5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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