Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG8Q8ND04 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMG8Q8ND04 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms