Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11CQ8NB49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP11CQ8NB49 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms