Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf52Q8N6N3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf52Q8N6N3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf52Q8N6N3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms