Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC155Q8N6L0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC155Q8N6L0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC155Q8N6L0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC155Q8N6L0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC155Q8N6L0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC155Q8N6L0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC155Q8N6L0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms