Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARM1Q86X55 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARM1Q86X55 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CARM1Q86X55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms