Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms