Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNKQ7Z7G1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLNKQ7Z7G1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNKQ7Z7G1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms