Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS12Q6ZW61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS12Q6ZW61 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms