Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXIP1Q6ZW49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAXIP1Q6ZW49 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXIP1Q6ZW49 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms