Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BLOC1S2Q6QNY1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BLOC1S2Q6QNY1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLOC1S2Q6QNY1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms