Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.285e-7■■■■□ 20.9
NIPBLQ6KC79 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 20.9
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NIPBLQ6KC79 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.55e-7■■■■□ 20.9
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NIPBLQ6KC79 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.9
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NIPBLQ6KC79 CSPP1-205ENST00000521168 1457 ntTSL 1 (best)3.92□□□□□ -1.783e-6■■■■□ 20.9
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NIPBLQ6KC79 AL390334.1-203ENST00000554904 569 ntTSL 43.68□□□□□ -1.823e-6■■■■□ 20.9
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