Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCSAPQ6IQ19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms