Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL3Q6DD88 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms