Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ANKRD40Q6AI12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ANKRD40Q6AI12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms