Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRAMEF18Q5VWM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF18Q5VWM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF18Q5VWM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms