Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTUD1Q5VV17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUD1Q5VV17 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms