Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
FRMPD1Q5SYB0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRMPD1Q5SYB0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms