Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EFHC1Q5JVL4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EFHC1Q5JVL4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFHC1Q5JVL4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms