Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN52Q52LA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN52Q52LA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN52Q52LA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms