Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf21Q32NC0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms