Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHQ16836 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHQ16836 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHQ16836 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHQ16836 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHQ16836 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHQ16836 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHQ16836 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHQ16836 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHQ16836 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHQ16836 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHQ16836 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHQ16836 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHQ16836 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHQ16836 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHQ16836 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHQ16836 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHQ16836 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHQ16836 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HADHQ16836 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHQ16836 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHQ16836 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHQ16836 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HADHQ16836 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HADHQ16836 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHQ16836 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHQ16836 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHQ16836 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHQ16836 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HADHQ16836 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHQ16836 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHQ16836 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHQ16836 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHQ16836 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHQ16836 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HADHQ16836 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHQ16836 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHQ16836 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHQ16836 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HADHQ16836 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms