Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN1Q16799 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN1Q16799 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTN1Q16799 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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