Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB1Q16558 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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KCNMB1Q16558 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNMB1Q16558 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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