Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP11Q15643 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms