Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ANKRD1Q15327 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD1Q15327 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ANKRD1Q15327 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD1Q15327 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD1Q15327 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD1Q15327 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms