Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL9A2Q14055 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL9A2Q14055 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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