Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL4A6Q14031 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A6Q14031 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A6Q14031 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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