Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALCAMQ13740 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALCAMQ13740 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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