Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA1SQ13698 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA1SQ13698 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CACNA1SQ13698 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA1SQ13698 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
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