Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOP3AQ13472 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOP3AQ13472 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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