Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140Q13342 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP140Q13342 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP140Q13342 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP140Q13342 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP140Q13342 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140Q13342 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140Q13342 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140Q13342 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140Q13342 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP140Q13342 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140Q13342 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140Q13342 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140Q13342 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140Q13342 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP140Q13342 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140Q13342 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140Q13342 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140Q13342 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140Q13342 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP140Q13342 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP140Q13342 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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SP140Q13342 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140Q13342 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140Q13342 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140Q13342 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140Q13342 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140Q13342 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP140Q13342 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP140Q13342 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP140Q13342 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP140Q13342 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP140Q13342 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140Q13342 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140Q13342 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140Q13342 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140Q13342 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140Q13342 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP140Q13342 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140Q13342 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140Q13342 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140Q13342 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140Q13342 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140Q13342 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140Q13342 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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