Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 38
PABPC4Q13310 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 38
PABPC4Q13310 POU2F1-208ENST00000443275 12939 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 38
PABPC4Q13310 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 25.22□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 38
PABPC4Q13310 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.664e-7■■■■■ 38
PABPC4Q13310 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 38
PABPC4Q13310 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 222.12■■□□□ 1.135e-12■■■■■ 38
PABPC4Q13310 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.98e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.2■■□□□ 1.468e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 SIL1-215ENST00000515008 843 ntTSL 321.43■■□□□ 1.028e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-16■■■■■ 38
PABPC4Q13310 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.888e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.738e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 519.46■□□□□ 0.718e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.78e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 COX20-205ENST00000498262 2290 ntTSL 219.1■□□□□ 0.651e-16■■■■■ 38
PABPC4Q13310 TRNAU1AP-205ENST00000480930 1132 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.538e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 COX20-202ENST00000391839 1005 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.461e-16■■■■■ 38
PABPC4Q13310 TRNAU1AP-206ENST00000484775 1008 ntTSL 516.59■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 TRNAU1AP-207ENST00000491577 1610 ntTSL 216.28■□□□□ 0.28e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.178e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-16■■■■■ 38
PABPC4Q13310 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PPARGC1B-205ENST00000434684 2457 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.088e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.18e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.138e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 STRIP1-205ENST00000485775 3363 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.438e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 STRIP1-204ENST00000473429 4870 ntTSL 211.02□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-223ENST00000495484 1896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.718e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.778e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.788e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.828e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PPARGC1B-207ENST00000492495 572 ntTSL 29.56□□□□□ -0.888e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.958e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.978e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.098e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-216ENST00000414367 3357 ntTSL 58.01□□□□□ -1.138e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.28e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.218e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-204ENST00000373956 6931 ntTSL 57.31□□□□□ -1.248e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-219ENST00000448885 6937 ntTSL 56.77□□□□□ -1.338e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.348e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.348e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.398e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.48e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.498e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.518e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.518e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.538e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 BRAF-204ENST00000496384 8294 ntTSL 55.46□□□□□ -1.538e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.568e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.568e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.568e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.588e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.628e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.678e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.698e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.798e-9■■■■■ 38
PABPC4Q13310 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 37.9
PABPC4Q13310 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.537e-7■■■■■ 37.9
PABPC4Q13310 DPP7-206ENST00000473532 1144 ntTSL 520.68■□□□□ 0.97e-7■■■■■ 37.9
PABPC4Q13310 MXD3-205ENST00000503473 2279 ntTSL 527.96■■■□□ 2.073e-6■■■■■ 37.9
PABPC4Q13310 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.096e-6■■■■■ 37.8
PABPC4Q13310 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 37.8
PABPC4Q13310 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-8■■■■■ 37.8
PABPC4Q13310 POP4-207ENST00000587232 608 ntTSL 26.17□□□□□ -1.428e-9■■■■■ 37.7
PABPC4Q13310 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 37.7
PABPC4Q13310 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-212ENST00000567193 915 ntTSL 217.45■□□□□ 0.383e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-204ENST00000563168 1525 ntTSL 216.02■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-203ENST00000562235 775 ntTSL 215.81■□□□□ 0.123e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-205ENST00000563271 614 ntTSL 215.48■□□□□ 0.073e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-209ENST00000564649 514 ntTSL 213.53□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-210ENST00000565201 832 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.343e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 TMEM208-206ENST00000563426 457 ntTSL 312.91□□□□□ -0.343e-11■■■■■ 37.6
PABPC4Q13310 DDX49-213ENST00000602113 1691 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 DDX49-205ENST00000596502 594 ntTSL 217.86■□□□□ 0.454e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 DDX49-204ENST00000595858 1882 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 KYAT3-202ENST00000370486 1019 ntTSL 514.82□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.86e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.216e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.426e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 KYAT3-204ENST00000446900 1937 ntTSL 52.89□□□□□ -1.956e-8■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 GRIPAP1-212ENST00000619149 2828 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.299e-14■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.52e-7■■■■■ 37.5
PABPC4Q13310 CISD3-206ENST00000619858 2326 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 37.5
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