Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 35.3
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TARDBPQ13148 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 523.38■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 221.65■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-19■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ARNT-204ENST00000471844 3703 ntTSL 211.94□□□□□ -0.54e-19■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.324e-19■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 327.34■■□□□ 1.974e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.214e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.394e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 FAM129A-203ENST00000461167 904 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 FAM129A-204ENST00000487074 3118 ntTSL 510.09□□□□□ -0.794e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.014e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.034e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-205ENST00000523704 408 ntTSL 38.04□□□□□ -1.124e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-210ENST00000519329 541 ntTSL 37.3□□□□□ -1.244e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.274e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-208ENST00000522646 548 ntTSL 36.29□□□□□ -1.44e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-207ENST00000522303 526 ntTSL 54.87□□□□□ -1.634e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.734e-11■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.081e-9■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-9■■■■■ 35.3
TARDBPQ13148 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.469e-7■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 513.59□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 VCL-206ENST00000623461 7995 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 VCL-207ENST00000624354 3307 ntTSL 28.38□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 35.2
TARDBPQ13148 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-14■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-14■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-14■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 ERH-204ENST00000557697 167 ntTSL 5-0.34□□□□□ -2.462e-14■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 219.98■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 35.1
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TARDBPQ13148 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 58.14□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 CDR2-207ENST00000569045 826 ntTSL 516.84■□□□□ 0.296e-10■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 CDR2-204ENST00000564542 1056 ntTSL 514.53□□□□□ -0.086e-10■■■■■ 35.1
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TARDBPQ13148 CDR2-203ENST00000563573 556 ntTSL 44.3□□□□□ -1.726e-10■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 PIP4K2A-208ENST00000605011 558 ntTSL 47.63□□□□□ -1.192e-8■■■■■ 35.1
TARDBPQ13148 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 35.1
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TARDBPQ13148 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.474e-9■■■■■ 35.1
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TARDBPQ13148 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.275e-8■■■■■ 35
TARDBPQ13148 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 314.43□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 34.9
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TARDBPQ13148 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 39.83□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 28.78□□□□□ -19e-7■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 TASP1-206ENST00000480436 2302 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.989e-9■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-10■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-10■■■■■ 34.9
TARDBPQ13148 KMT2C-207ENST00000452749 479 ntTSL 512.46□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 34.8
TARDBPQ13148 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 34.8
TARDBPQ13148 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 34.8
TARDBPQ13148 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 34.8
TARDBPQ13148 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 215.21■□□□□ 0.033e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 212.47□□□□□ -0.413e-83■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 34.7
TARDBPQ13148 ACTR1A-207ENST00000636707 1046 ntTSL 512.62□□□□□ -0.392e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 ACTR1A-205ENST00000487599 2726 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 ACTR1A-202ENST00000470322 3519 ntTSL 29.02□□□□□ -0.972e-32■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 LPIN1-213ENST00000464953 627 ntTSL 315.38■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 34.6
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